Fukoxantín je ďalší dôležitý xantofyl.Vo veľkej miere sa vyskytuje v heterokontofytách, ako sú hnedé riasy a oceánske mikroriasy, a verí sa, že je druhým najrozšírenejším karotenoidom na Zemi po β-karoténe.V poslednej dobe sa stále viac uskutočňujú štúdie o funkčnosti fukoxantínu a ukázalo sa, že fukoxantín má rôzne prospešné fyziologické aktivity.